Les Tokubetsu Jônin (特別上忍, signifiant littéralement : Ninja Supérieur Spécial) sont des jônin spéciaux qui se spécialisent pour une tâche précise comme être des examinateurs à l'Examen Chûnin ou dans la récolte d'information ou de recherche. Ces jônin ne peuvent pas être les senseï d'une équipe de jeunes genin. Ils participent néanmoins à des tâches et des missions importantes et dans lesquelles ils sont spécialisés.
Comme Tokubetsu Jônin nous pouvons noter :